初期症状は、以下のような一般的な風邪やインフルエンザの症状と区別がつきにくい場合があるので注意が必要です。

・発熱
・頭痛
・吐き気、嘔吐
・筋肉の痛み

その他、髄膜炎菌感染症には以下のような症状があります。

・ 錯乱（混乱して考えがまとまらない、物事を理解できない）
・ うなじのこわばり（首の後ろが硬直しあごを傾けられない）
・ 発疹、出血性皮疹（赤や紫色の斑点状の発疹）
・ 光に対する過剰な感覚（光が異様にギラギラ輝いて見える、異常にまぶしく感じる等）
・ 手足の痛み

乳幼児においては、上記以外に下記の症状にも注意が必要です。

・手足が冷たい
・顔色が悪い
・眠気、低緊張、無反応、目覚めにくい
・異常な泣き方、うめき、怒りっぽい
・触れられるのを嫌がる
・抑えられないふるえ
・授乳・食事を嫌がる
・頭部のこわばり/膨らみ（通常軟らかい部分）
・呼吸促迫（呼吸が速い）、呼吸困難

・注意すべき症状のいずれかが認められた場合は、ただちに担当医師または緊急時受診可能医療機関に連絡してください。
・担当医師または緊急時受診可能医療機関と連絡が取れない場合、すぐに救急車を呼び、患者安全性カードを救急救命室のスタッフに提示してください。